Одной из сторон, обеспечивающих успешное функционирование Университета Пандоры, является грамотное разделение обязанностей между различными сферами деятельности, каждой из которых занимается определённый отдел. Ниже перечислены отделы Университета, функционирующие в данный момент:
Административный отдел
Административный отдел является прямым аналогом правительства и занимается разработкой задач, составлением документации, распределением ресурсов, долгосрочным планированием, бухгалтерией, назначением и распределением сотрудников. И хотя подавляющее большинство сотрудников отдела работают в командных центрах, в его состав также входит руководящий персонал баз и дочерних организаций. Наивысшее положение в административном отделе, как и во всём Университете, занимают Стратеги - девять высших руководителей, объединённых в орган под названием Конклав Стратегов. В конспиративных целях личности всех членов Конклава строго засекречены, вместо них используются номерные обозначения (с С-1 по С-9).
Инженерный отдел
Среди всех отделов Университета, инженерный является наиболее многочисленным. В его компетенцию входит постройка новых баз и поддержание работоспособности существующих, проектирование камер содержания, организация производства ресурсов и материалов, подготовка экспериментов. И хотя сотрудники данного отдела присутствуют во всех учреждениях, подконтрольных Университету, их наиболее частым местом работы являются промышленные базы.
Научный отдел
Научный отдел можно смело называть мозговым центром всего Университета. В его задачи входит исследование объектов, в том числе разработка способов их содержания и нейтрализации, развитие паранаук, проведение экспериментов, также именно научный отдел занимается разработкой новых изобретений и технологий на паранормальной основе.
Военный отдел
Военный отдел является вооружённой силой Университета и его силовой опорой. В его компетенцию входит защита подконтрольных учреждений, организация и проведение военных операций, уничтожение опорных пунктов враждебных ГОИ и нейтрализация опасных объектов. В критических ситуациях военный отдел может вести полномасштабные военные действия.
Разведывательный отдел
Из всех отделов, разведывательный является наиболее децентрализованным. Данный отдел не имеет иерархии в привычном смысле, вместо этого подразделяясь на обособленных полевых агентов. В их задачи входит внедрение в различные структуры нормального и паранормального мира, уничтожение данных о паранормальной активности в гражданских информационных базах, распространение дезинформации, поиск паранормальной активности, мониторинг наблюдаемых объектов, шпионаж и проведение саботажа в рядах враждебных ГОИ.
Дипломатический отдел
Среди всех отделов дипломатический имеет наименьшее количество сотрудников, из-за чего недооценивается некоторыми сотрудниками. Тем не менее, важность его велика. Задачами дипломатического отдела являются работа с гражданским населением, представительство Университета при заключении договоров, налаживание взаимоотношений с паранормальными цивилизациями, кадровая деятельность.
Отдел внутреннего контроля
Отдел внутреннего контроля представляет собой глубоко законспирированную и засекреченную структуру, практически параллельную основной иерархии Университета. Его миссией является выявление вражеских агентов и нелояльных сотрудников среди персонала самого Университета. В связи с нестандартностью своей миссии, отдел внутреннего контроля не имеет сотрудников в привычном понимании. Его сотрудники могут иметь любые должности, выполняя свою работу в отделе внутреннего контроля параллельно основной. Зачастую, их истинная деятельность может открываться лишь на особого рода тайных собраниях.
Приписанный персонал
Зачастую, недостаточная независимость и отсутствие полноценной иерархии приводят к невозможности организации полноценного отдела среди сотрудников определённой специальности. В этом случае они классифицируются в качестве приписанного персонала - особой категории сотрудников, не имеющей своего отдела и тесно работающей с существующими. Ниже приведён список видов приписанного персонала, действующий в данный момент:
Медики - в компетенцию медиков оказание сотрудникам Университета и пострадавшим в ходе паранормальных инцидентов гражданским медицинской помощи. Зачастую, опытные медики выбирают себе дополнительную специализацию, специализируясь на излечении конкретных проблем со здоровьем.
Испытуемые - испытуемые представляют собой особую категорию персонала, задействованную в экспериментах с паранормальными объектами на постоянной основе. Всем испытуемым присваивается специализированный класс омега.
Курьеры - задачей курьеров является оперативная транспортировка ресурсов, материалов, объектов и сотрудников с помощью различных транспортных средств.
